Metrics
0 Downloads
Share Dataset

Share this dataset on your favorite social media networks.

Analiza struktur mózgu u pacjentów z zespołem Ushera przeprowadzona za pomocą rezonansu magnetycznego o natężeniu pola 7 tesli

Version 1.0

Nowomiejska, Katarzyna, 2026, "Analiza struktur mózgu u pacjentów z zespołem Ushera przeprowadzona za pomocą rezonansu magnetycznego o natężeniu pola 7 tesli", https://doi.org/10.18150/H7ECUK, RepOD, V1

Learn about Data Citation Standards.

Description

Do badania włączono dwudziestu pacjentów z rozpoznaniem zespołu Ushera (USH) oraz piętnastu zdrowych ochotników dopasowanych pod względem wieku i płci. Wszyscy pacjenci zostali poddani badaniu MRI mózgu o natężeniu pola 7 tesli w dwóch sekwencjach: sekwencji 3D BRAVO z obrazowaniem T1 oraz sekwencji 3D SILENT z obrazowaniem MT.

Dane zostały uzyskane przy użyciu skanera MRI 7T Discovery MR950 (GE Healthcare, Chicago, IL, USA).

Zbiór obejmuje dane dwóch przykładowych uczestników:

  • sub_358
  • sub_359

Wszystkie pliki zostały poddane anonimizacji poprzez usunięcie danych identyfikujących.

Dane zostały zorganizowane w jednym archiwum ZIP zawierającym foldery odpowiadające poszczególnym uczestnikom:

  • sub_358
  • sub_359


Każdy folder zawiera dwie sekwencje obrazowe w oddzielnych podfolderach:

  • seq_t1w: T1-weighted (Ax BRAVO)
  • 180 warstw. Trójwymiarowa sekwencja anatomiczna o wysokiej rozdzielczości przeznaczona do analiz anatomicznych i morfometrycznych.
  • seq_mt: Magnetization Transfer (Silent7T MT)
  • 224 warstwy. Sekwencja wykorzystująca zjawisko transferu magnetyzacji, zwiększająca czułość na właściwości mikrostrukturalne tkanek.

Łącznie zbiór zawiera 808 plików DICOM (.dcm), po 404 pliki na uczestnika (180 dla seq_t1w + 224 dla seq_mt).

Każdy plik został nazwany zgodnie z jednolitą konwencją:

sub_<ID>_seq_<t1w|mt>_slice_<numer>.dcm

gdzie:

subject – identyfikator uczestnika (np. sub_380)

sequence – typ sekwencji obrazowania (T1-weighted lub Magnetization Transfer)

slice number – numer warstwy obrazu

Dane udostępnione są w formacie DICOM (Digital Imaging and Communications in Medicine) – międzynarodowym standardzie zapisu i wymiany obrazów medycznych, stanowią oryginalne pliki bez konwersji i kompresji stratnej.

Każda sekwencja stanowi odrębną serię DICOM zawierającą komplet warstw umożliwiających rekonstrukcję trójwymiarowej objętości. Pliki zawierają zarówno dane obrazowe, jak i pełne metadane akwizycji (m.in. TR, TE, flip angle, rozdzielczość przestrzenną).

Format DICOM jest standardem otwartym i szeroko wspieranym przez oprogramowanie badawcze i kliniczne. Dane mogą być bezpośrednio przeglądane w przeglądarkach DICOM, konwertowane do formatu NIfTI (.nii/.nii.gz) oraz wykorzystywane w środowiskach analizy neuroobrazowej. Oprogramowanie open source obsługujące format DICOM obejmuje m.in. 3D Slicer, dcm2niix oraz FSL.


(2026-04-24)
Subject
Medicine, Health and Life Sciences
Keyword

droga wzrokowa, zespół Ushera

Related Publication

Nowomiejska K, Czarnek-Chudzik A, Niedziałek A, Toborek M, Midura M, Rejdak R, Pietura R. Structural Abnormalities of the Brain Detected by 7 Tesla MRI in Patients with Usher Syndrome. J Clin Med. 2025 Sep 15;14(18):6493. doi: 10.3390/jcm14186493. PMID: 41010697; PMCID: PMC12470460. https://doi.org/10.3390/jcm14186493 doi: 10.3390/jcm14186493

CC0 Creative Commons Zero 1.0 CC0 Creative Commons Zero 1.0

1 File
7T_MRI_brain_DICOM_dataset_in_usher_syndrome.zip
ZIP Archive - 163.8 MB - May 5, 2026 - 0 Downloads
MD5: dd4def6357c837e84e346b4c07425cab
License: CC0 Creative Commons Zero 1.0
Download
Select File(s)

Please select a file or files to be deleted.

Delete Files

The file(s) will be deleted after you click on the Delete button.

Files will not be removed from previously published versions of the dataset.

Select File(s)

Please select a file or files to be edited.

Select File(s)

Please select a file or files to be edited.

Select File(s)

Please select a file or files to be edited.

Edit license

For selected file(s) set a license to

Select File(s)

Please select a file or files to be downloaded.

Select File(s)

Please select a file or files for access request.

Select File(s)

Please select restricted file(s) to be unrestricted.

Request Access

  You need to Log In/Sign Up to request access to this file.

Continue
Dataset Terms

Please confirm and/or complete the information needed below in order to continue.

Asterisks indicate required fields

Request Access

Access to file(s) subject to additional consent under following conditions:

Accept
Package File Download
Restricted Files Selected

The restricted file(s) selected may not be downloaded because you have not been granted access.

Restricted Files Selected

The restricted file(s) selected may not be downloaded because you have not been granted access.

Click Continue to download the files you have access to download.

Delete Dataset

Are you sure you want to delete this dataset and all of its files? You cannot undelete this dataset.

Embargo

Embargo

Are you sure you want to lift the embargo?

Once you lift the embargo, you will not be able to set it again.

Delete Draft Version

Are you sure you want to delete this draft version? Files will be reverted to the most recently published version. You cannot undelete this draft.

Dataset Anonymized Private URL

Use a Anonymized Private URL to allow those without Dataverse accounts to access your dataset. For more information about the Private URL feature, please refer to the User Guide.

Private URL has not been created.

"WARNING. This dataset has at least one published version. Those who have access to the Anonymized Private URL for this dataset may be able to use its accessible metadata to look up the full, not anonymized version of this dataset.

Dataset Anonymized Private URL

Are you sure you want to disable the Private URL? If you have shared the Private URL with others they will no longer be able to use it to access your dataset.

Dataset Private URL

Use a Private URL to allow those without Dataverse accounts to access your dataset. For more information about the Private URL feature, please refer to the User Guide.

Private URL has not been created.

Dataset Private URL

Are you sure you want to disable the Private URL? If you have shared the Private URL with others they will no longer be able to use it to access your dataset.

Submit for Review

You will not be able to make changes to this dataset while it is in review.

Submit
Publish Dataset

This dataset cannot be published until RepOD is published. Would you like to publish both right now?

Once you publish this dataset it must remain published.

Publish Dataset

Are you sure you want to republish this dataset?

Select if this is a minor or major version update.

Publish Dataset

This dataset cannot be published until RepOD is published by its administrator.

Publish Dataset

This dataset cannot be published until RepOD and are published.

Return for modification


Send a copy of this message to the return e-mail address.
OK
Deaccession Dataset

Are you sure you want to deaccession? The selected version(s) will no longer be viewable by the public.